در راستای ارتقا علمی تحقیقات در زمینه امر به معروف و نهی از منکر پژوهشکده «امر به معروف و نهی از منکر» اقدام به عقد تفاهم نامه همکاری علمی پژوهشی با موسسه آموزشی و پژوهشی امام خمینی (ره) کرده است. برخی از مفاد تفاهم نامه در دو بخش آموزشی و پژوهشی به قرار ذیل است.
۱. تبادل اساتید جهت تدریس، راهنمایی و مشاوره پایان‌نامه‌های مقاطع فوق‌لیسانس و دکترا.
۲. همکاری در برگزاری کارگاه های علمی و دوره‌های کوتاه مدت تخصصی مشترک برای کارکنان، مدیران، دانشجویان و اعضای هیأت علمی.
۳. انتقال تجارب در زمینه‌های زیرساخت های فناوری و برنامه‌های نرم‌افزاری آموزش‌های غیرحضوری(آموزش از راه دور)
۴. مبادله نرم‌افزارها، کتاب‌ها، فیلم‌ها و نوارهای آموزشی و بانک‌های اطلاعاتی آموزشی.
۵. همکاری و زمینه‌سازی برای استفاده از امکانات و فضاهای آموزشی طرفین.
۶. همکاری و تبادل اطلاعات و تجربیات در زمینه مدیریت، برنامه‌ریزی، و روش‌های نوین آموزشی.
۷. مبادله تجربیات برای طراحی دوره‌ها و رشته‌های جدید و تخصصی تحصیلی.
۸. مبادله تجربیات در زمینه آئین‌نامه‌ها، دستورالعمل‌ها وفرم‌های آموزشی.
۹. همکاری در برگزاری دوره‌ها و رشته‌های آموزشی بصورت مجازی.
آموزشی
۱. شناسایی و معرفی متخصصان و پژوهشگران در تخصص‌های مورد نیاز هر یک از طرفین.
۲. پذیرش محققان، اساتید و دانش‌پژوهان حائزشرایط برای فرصت مطالعاتی در هریک از دو مرکز.
۳. همکاری و مشارکت در تدوین متون آموزشی و کمک‌آموزشی.
۴. مشارکت و همکاری در برگزاری همایش‌ها،کارگاه‌ها و نشست‌های مشترک علمی و نمایشگاه‌های علمی و فرهنگی
۵. تبادل منابع، آثار، مستندات و اطلاعات علمی تخصصی طرفین مانند کتب، مجلات تخصصی، مقالات، پایان‌نامه‌ها، نرم‌افزارها، فیلم و نوار.
۶. همکاری و زمینه‌سازی برای استفاده از تجارب، تولیدات و امکانات نرم‌افزاری و سخت‌افزاری و فضاهای علمی- پژوهشی در امر پژوهش.
۷. همکاری و مشارکت در نشر و توزیع کتب و نشریات علمی- پژوهشی در سطح ملی و بین‌الملل.
۸. مشارکت در تأمین محتوا و نشر مجلات و سایت‌های علمی و تخصصی.
۹. زمینه‌سازی برای ارتباط انجمن های علمی طرفین.
۱۰. همکاری در ترجمه متون مورد نیاز از زبان فارسی به زبان‌های دیگر و از زبان‌های دیگر به زبان فارسی.
۱۱. همکاری در زمینه استفاده دانش‌پژوهان، اساتید، کارکنان هر دو مجموعه از امکانات و منابع کتابخانه‌ای و پایان‌نامه‌ها.
فرهنگی ترویجی
۱. استفاده از محصولات فرهنگی طرفین مانند تک نگاره ها، مجلات فرهنگی.
۲. بهره‌مندی متقابل از امکانات و فضاهای طرفین برای اردوهای فرهنگی.
۳. مشارکت و همکاری متقابل در برگزاری اردوها، جشنواره‌ها، المپیادهای قرآنی و فرهنگی- تربیتی.
۴. همکاری در زمینه ایجاد بانک دیجیتال متون آموزشی، پژوهشی و کتابخانه‌ای و همچنین نشریاتی که توسط دو مجموعه منتشر می‌شود.